Magister Negi Magi! คุณครูจอมเวท เนกิมะ! เนกิ สปริงฟิลด์ พ่อมดอัจฉริยะเชื้อสายเวลส์ซึ่งอายุสิบปีที่เพิ่งจบการศึกษาจากโรงเรียน เวทมนตร์ เนื่องจากได้รับคำสั่งเพื่อเป็นทางผ่านไปสู่จอมทเวทที่สูงส่งให้ได้ โดยถูกส่งไปประเทศญี่ปุ่นเพื่อทำงานเป็นครูสอนภาษาอังกฤษในของโรงเรียนสตรี ระดับมัธยมต้นแห่งหนึ่งนอกจากเนกิจะต้องดูแลนักเรียนหญิง 31 ที่อายุมากกว่าและไม่ได้เคราพเขาอย่างอาจารย์ ทั้งนี้ยังต้องฝึกปรือเวทมนตร์ของตัวเองเพื่อเป็นพ่อมดผู้เก่งกาจตามรอยของ นากิสปริงฟิลด์ บิดาผู้หายสาปสูญ